Eestis reguleerib meditsiinilise sünnitõendi väljastamise ja isikukoodide moodustamise põhimõtteid siseministri määrus nr 1 „Isikukoodide moodustamise ja andmise kord“ §5. Lapse sünni registreerib tervishoiuteenuse osutaja, kes andis sünnitusabi.
Kui naine otsustab kodus sünnitada, tuleb lähtuda juhendist „Planeeritud kodusünnitusabi Eestis“, millest tulenevalt võib kodusünnitusabi osutada ainult Terviseameti tegevusloaga ämmaemand, kes väljastab lapsele sünnitõendi (ilma isikukoodita). Ämmaemanda sünnitõendi alusel väljastab isikukoodi perekonnaseisuamet või kohalik omavalitsus lapsele nime panemisel (sünni registreerimisel).
Kui on tegemist assisteerimata kodusünnitusega, kuhu naine ei soovi tegevusloaga tervishoiutöötajat ega ka enda ja lapse hilisemat haiglas läbivaatamist, peab naine emadust ja lapse põlvnemist tõestama kohtus. Sellisel juhul ei saa tervishoiuteenuse osutaja meditsiinilist sünnitõendit väljastada ja kinnitada toimingut, millega nad ei ole olnud seotud.
Kui naise sünnitegevus on nii kiire, et ta ei jõua haiglasse ja laps sünnib kodus/autos, tuleb pöörduda võimalikult kiiresti lähimasse haiglasse või kutsuda kiirabi, kes naise ja lapse haiglasse toimetab.
Kui naine sünnitab kodus, kuid on rasedusega olnud Lõuna-Eesti Haiglas jälgimisel, tema raseduse kulg on rasedust jälgivale günekoloogile/ämmaemandale täpselt teada, siis saab sünni registreerida Lõuna-Eesti Haiglas. Selleks peab naine koos vastsündinu ja platsentaga pöörduma pärast sünnitust esimesel võimalusel, kuid mitte hiljem kui 24h jooksul, haiglasse. Haiglas tuleb viibida minimaalselt 6 tundi, vajadusel ka kauem, et arst saaks tuvastada põlvnemise ning nii ema kui ka lapse üle vaadata ja vajalikud protseduurid teha. Seejärel sünd registreeritakse.